O ministro da Justiça, Márcio Thomaz Bastos, disse que haverá punições se os policiais cometeram excessos no revide aos suspeitos dos atentados em São Paulo. A garantia foi dada ao ministro pelo próprio governador de São Paulo, Cláudio Lembo, depois de um encontro entre os dois.

De acordo com o site Globo Online, Thomaz Bastos não quis fazer críticas às autoridades de São Paulo pelo elevado número de mortes de suspeitos, dizendo não ter elementos para saber se houve excesso da polícia ou não. Segundo o Movimento Nacional de Direitos Humanos, há entre os suspeitos assassinados pessoas que nada tinham a ver com o crime organizado.